农林科技系是学院办学历史悠久、师资最为雄厚的教学系之一。现开设有园林技术、植物保护、生物技术及应用、食品加工技术、园艺技术、林业技术和作物生产技术等7个专业，其中园林技术专业为重庆市级示范专业，植物保护专业为教育部支持建设专业。本系现有普通全日制在校学生1575人，专任教师48人，校内兼课教师9人，其中教授3名、副教授22名、高级实验师2名、双师素质教师39名、省部级教学名师2名、重庆市万州区科技特派员5名、国家职业技能鉴定考评员13人，其中高级考评员9人。校外兼职教师36人，校外兼课教师15人。现建设有校内实训中心3个，校内实训室35个，校内实训工场2个，实习实训设备价值800余万元；校外实训基地52个。

　　目前，建设有市级优质资源共享课程2门（《园林树木学》、《园林规划设计》），院级精品课程10门（《园林工程》、《花卉生产技术》、《果树生产技术》、《园林工程预决算》、《森林调查技术》、《园林植物栽培养护》、《园林植物保护》、《农作物有害生物防治技术》、《植物组织培养》、《植物化学保护》）。市级教学团队1个（园林技术专业教学团队），院级教学团队1个（植物保护专业教学团队）。

　　近两年，系部教师公开发表论文累计80余篇，其中核心期刊36篇，主持科研及教改课题（项目）46项，其中重庆市级科技项目29项，已结题12项；重庆市级教改项目6项，已结题2项；万州区科委科技项目6项。科研教改成果3项。主持编写教材17本，其中校企合作开发教材15本。

　　2012年参加全国职业技能大赛获得一等奖1项（植物组织培养项目），二等奖3项。2013年参加全国职业技能大赛获得一等奖1项（茶叶中重金属含量的检测），二等奖2项。