福建农业职业技术学院生物技术系成立于2003年8月，设有6个专业，现有全日制在校学生651人，教职工31人。目前，生物技术系拥有2个产品研发中心、5个实验实训中心、专业优势突出、办学特色明显、办学条件良好、毕业生就业率高。

　　办学条件：本系拥有较完善的实验、实训、实习设备设施，包括化学实验室、微生物实验室、植物生理实验室、生物工程实验室、食品生物技术实验室、遗传育种实验室、植物病虫实验室、组织培养实验室、食品加工与检验实验室、环境监测实验室、食用菌实验室等。此外，本系在学院内还与相关企事业单位共建200多亩农业生态园、组培中心等实训基地，并与校外三十多家企业（如：八十五度(福州)餐饮管理有限公司、三明绿宝农业技术服务有限公司、漳州市英格尔农业科技有限公司、福建西子湾水产有限公司、明一(国际)乳品有限公司、福建仙芝楼生物科技有限公司、福建澳牛乳业有限公司、厦门华净生物科技有限公司、闽清丰达农业生态大观园、厦门中夏蔬菜种籽有限公司、农友种苗(中国)有限公司、福州永丰菌业有限公司等）合作建立了多个校外实训基地。

　　专业设置：现设有食品生物和生物技术两个教研室，开设生物技术及应用、食品加工技术、食品生物技术（营养与保健方向）、食品生物技术（检验方向）、环境监测与治理技术、种子生产与经营、观光农业等六个专业（七个方向）。其中生物技术及应用为院级重点专业，食品类专业为闽台“校校企”联合培养人才项目专业，从2009年开始至今每年均招收闽台合作班，输送学生赴台学习生活，积极促进两岸文化交流与发展。本系现有省级精品课程1门，院级精品课程10门，院级重点课程10门。

　　师资队伍：建系以来，生物技术系本着“厚德强技、学以致用”的办学方针，参照国内一流的高职教育标准，建立了既与国内一流高职院校接轨又与福建省经济社会发展需要相符合的生物技术学科和教育体系。全系师生员工努力贯彻立系宗旨，引进一流的师资，目前共有教师31人，其中高级职称8人，中级职称17人，初级职称6人。其中博士学位在读1人，硕士学位（含在读）20人，大本中高级职称教师8人，“双师素质”教师18人，师资结构合理。同时各专业还聘请了多名校外具有生产、科研、管理等第一线技术人员和台湾高校专家教授为兼职教师，强化教师队伍素质。自成立以来，本系专任教师在省级以上刊物发表论文100多篇，出版（主编、参编）各类教材30多部，承担国家、省、市厅、院级教学科研项目50多项。

　　毕业生就业：生物技术系的目标是培养德、智、体、美、劳全面发展，掌握系统的基础理论知识，同时具备较强专业实践能力的高素质、技能型人才，能从事生物技术应用、食品生产与加工，食品营养与保健、种子生产与经营、观光农业（休闲旅游）、环境监测与保护等相关行业工作。生物技术系设有专门的就业指导机构，与30多家省内外各类企事业单位签订了校内外实训（就业）协议，为毕业生提供了大量的就业岗位；近三年毕业生就业率高达99%，赢得了良好的社会声誉，多次荣获院“毕业生就业工作先进集体”荣誉称号。

　　办学特色：生物技术系创新人才培养模式，构建了生物技术及应用专业（群）“学做交互、技能递进‘231’”人才培养模式，该模式自2009级生物技术及应用专业（群）所有专业推广实施，取得了良好教学效果，毕业生受到用人单位的高度赞赏和亲睐。