生物与环境分院以创办于1950年的嘉兴农校为前身，2000年经专业整合成立嘉兴职业技术学院（筹）农业与生物技术系，2008年更名为生物与环境分院。现设有动物防疫与检疫（省财政支持的免学费专业）、畜牧兽医（省财政支持的免学费专业）、商品花卉（省财政支持的免学费专业），园林技术、食品药品监督管理、环境监测与治理、工程造价、建筑工程技术、建筑装饰工程技术等9个专业。其中动物防疫与检疫专业为省高职高专重点专业、商品花卉专业为省高职高专特色专业，两专业同时为省示范校建设项目财政资助的重点建设专业。分院拥有现代农业发展研究所1个、嘉兴市农产品质量安全与检测重点实验室1个。