生物与化学工程学院历经发酵工程系、食品工程系、轻化工程系和化学工程系并于2003年转制成为目前的名称。学院于2000年开始招收本科学生，目前设有“化学工程与工艺”、“应用化学”、“生物工程”、“环境工程”、“制药工程”5个本科专业，且均授予工学学士学位；“应用化学”为省级重点学科，“化学工程与技术”为校级A类重点建设学科，“环境工程”为校级重点培育学科；“化学工程与工艺”专业为省级重点建设专业，“环境工程”为校级重点建设专业，应用化学专业是学校“产学研合作人才培养模式”试点专业。学院有应用化学系、化学与制药工程系、环境与生物工程系三个系以及精细化工、应用化学、绿色催化、生物工程、环境及资源技术5个研究所，共计11个科研团队、3个教学团队和3个嘉兴市重点科技创新团队。现有班级38个，在校学生1400余人。

　　2014年起，学院5个本科专业实行按大类（化工与制药类）招生，学生进校一年后进行专业分流，实行满足国家、社会、学生多样性需求的“多层次、多方向、多路径”人才培养模式和专业综合改革；2015年起学院化工与制药类面向全省开始“三位一体” 招生和面向全国招收应用化学国际化专业学生。学院一直注重学生的素质教育和创新能力的培养，努力倡导勤奋好学、开拓创新的学风，毕业生受到用人单位好评。近年来，我院学生承担国家级大学生创新创业训练计划、浙江省大学生科技创新活动计划（新苗人才计划）、校级重点STR计划等项目160余项。连续十二年，每年约有20%的应届毕业生考取其他高校攻读硕士学位，考取研究生的数量一直居全校之冠。

　　学院拥有一支素质过硬、学术造诣较深、富有创新精神、团结协作、爱岗敬业的师资队伍。现有教职工103人，共有专任教师71人，有浙江省钱江特聘教授2人、学科带头人5人、学术带头人1人、海外优秀博士2人、具有海外留学背景的教师19人、教授13人、副教授31人、硕士生导师15人；省“新世纪151人才工程”第一层次培养人员1人，第三层次培养对象3人，具有博士学位的教师比例达到77%，具有高级职称的教师比例达到62%。

　　学院由生化工程实验中心（基础化学实验室、工程专业实验室、学科科研实验室）、分析测试中心、浙江省芳烃磺酸工程技术研究中心、嘉兴市绿色化工工艺重点实验室等构成了一个较为完善的教学与研究平台，为教学、科研、社会服务提供了良好保障，生化实验中心为浙江省实验教学示范中心。分析测试中心已有核磁共振仪、气（液）质联用仪、高效液相色谱仪、气相色谱仪、X-射线粉末衍射仪、X-射线单晶衍射仪、扫描电子显微镜、等离子发射光谱仪、原子吸收分光光度计、原子力显微镜、红外停留光谱仪、紫外-可见-近红外光谱仪、同步热分析仪、差示扫描量热仪、傅里叶红外光谱仪、紫外-可见光谱仪、分子荧光光谱仪、电化学工作站、表面张力仪、激光粒度仪等一批大型分析测试仪器，用于满足教学与科研的需要，仪器设备价值3000余万元。分析测试中心的现代化管理系统使这个教学、科研平台具备了为全校师生提供全天候服务的能力。学院的持续发展将为中心增添更多的先进仪器与设备以满足来自教学和科研不断增加的需求。

　　近五年来，学院教师在国内外各类学术刊物上发表论文500余篇，其中SCI收录200余篇；获浙江省科技进步等各类奖30余项；获授权国家发明专利40余项；编写教材和专著6部；获得各类研究项目资助200余项，其中国家自然科学基金项目26项、浙江省自然科学基金项目23项、浙江省科技计划项目17项、其他省部级课题7项，与企业合作研发项目（横向课题）200余项，每年的科研经费逐步增加，呈现出良好的发展势头。

　　这是一所年轻而充满活力的学院，与校内外、国内外的同行有着广泛而密切的交流与联系。在国内外的学术会议上经常有学院教师的身影，平均每周外请的知名学者和每年一次在南湖学术论坛聚首的知名学者代表为学院的教师和学生提供了额外的学术营养和文化美餐。一年一度的研究生论坛为学院联合培养的研究生和来自其他兄弟院校的研究生提供了相互交流的平台。