微生物次生代谢物合成途径主要有4条：
①糖代谢延伸途径，由糖类转化、聚合产生的多糖类、糖苷类和核酸类化合物进一步转化而形成核苷类、糖苷类和糖衍生物类抗生素；
②莽草酸延伸途径，由莽草酸分支途径产生氯霉素等；
③氨基酸延伸途径，由各种氨基酸衍生、聚合形成多种含anjis 的抗生素，如多肽类抗生素、β-内酰胺类抗生素、D-环丝氨酸和杀腺癌菌素等；
④乙酸延伸途径，由可分2条支路，其一是乙酸经缩合后形成聚酮酐，进而合成大环内酯类、四环素类、灰黄霉素类抗生素和黄曲霉毒素；另一分支是经甲羟戊酸而合成异戊二烯类，进一步合成重要的植物生长雌激素——赤霉素或真菌毒素——隐杯伞素等。
初生代谢途径与次生代谢途径的联系
