依托国家淡水水产种质资源库珠江分库(挂靠单位中国水产科学研究院珠江水产研究所)保存的鱼类基因资源和数据资源,从131种鱼类基因组数据中筛选出直系同源基因,通过对31个目203个物种的PCR引物特异性和PCR扩增效率进行进一步筛选,初步开发了82个鱼类通用型核基因分子标记(FishPIE),并构建了鱼类60个目190个科710种鱼类的系统发育树,得到了与使用数百个标记的系统发育研究相当的分辨率。新标记的开发应用,可以实现对鱼类种质的快速分类和鉴定,在保障准确率的前提下,降低了现有技术耗时、费力、成本高的问题,同时为鱼类系统发育提供了一种新方案,丰富了基于分子标记对鱼类系统发育研究的基础数据。
研究工作得到国家重点研发计划(2018YFD0900705),中国-东盟海上合作基金(CAMC-2018F))和国家淡水水产种质资源库(FGRC18537)等项目资助。牟希东、杨叶欣和孙金辉为共同第一作者,牟希东和中山大学马嘉欣为共同通讯作者。
原文链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004222012974
来源:中国水产科学研究院