白菜是世界上栽培历史最悠久的蔬菜作物之一,是我国栽培面积最大的叶用蔬菜。作为芸薹属作物中第一个完成基因组测序的物种,白菜参考基因组为白菜作物的基因组研究和遗传改良奠定重要基础。但是,目前的白菜参考基因组仍然存在几百个缺口,其10条染色体的着丝粒结构组装均不完整。
该团队利用三代测序技术,获得接近完整的白菜基因组。该基因组填补了白菜基因组中绝大多数缺口,完成了8条染色体从端粒到端粒的完整组装,仅有2条染色体仍存在一个缺口;该基因组是目前组装最为完整的白菜基因组。研究还发现,着丝粒区域长末端重复序列的平均插入时间为14万年,显著晚于泛着丝粒区域,表明白菜的着丝粒区域经历着快速进化。
该研究得到国家重点研发计划、中国农业科学院科技创新工程项目等项目的支持。(通讯员:陈旭)
原文链接:
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.14015
2023年2月16日
来源:中国农业科学院蔬菜花卉研究所