微生物菌种保藏技术很多，但原理基本一致，即采用低温、干燥、缺旬、缺乏营养、添加保护剂或酸度中和剂等方法，挑选优良纯种，最好是它们的休眠体，使微生物生长在代谢不活泼、生长受抑制的环境中。
具体常用的方法有：蒸馏水悬浮或斜面传代保藏，干燥载体保藏或冷冻干燥保藏，超低温或在液氮中冷冻保藏等方法。
蒸馏水悬浮法
这是一种最简单的菌种保藏方法，只要将菌种悬浮于无菌蒸馏水中，将容器封好口，于10℃保藏即可达到目的。可用于好气性细菌和酵母等的保存。
