对微生物遗传规律的深入研究，不仅促进了遗传学向分子水平的发展，还促进了生物化学、分子生物学和生物工程学的飞速发展；由于它密切联系生产实践，故还为微生物和其他生物的育种工作提供了丰富的理论基础，促使育种工作从自发向着自觉、从低效转向高效、从随机转为定向、从近缘杂交朝着远缘杂交等发现发展。
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基因突变是遗传变异的基础，也是诱变育种的前提。其中以营养缺陷型和抗药性突变株为代表的选择性突变株，由于在菌种筛选中有着不可缺少的遗传标记功能，所以具有重要理论与实际应用。
在生物进化的历史长河中，遗传性的变异是绝对的，而其稳定性却是相对的；在变异中，退化性的变异是大量的，而进化性的变异却是个别的。
因此，如果对菌种工作任其自然、放任自流，不搞纯化、复壮和育种，则菌种就会对你进行“惩罚”，反映到生产上就会出现持续的低产、不稳定。
