第一步：纠正、消除产生偏离的原因，将CCP返回受控状态之下。一旦发生偏离CL，应立即报告，并立即采取纠正措施，所需时间愈短则就使加工偏离CL的时间愈短，这样就能尽快恢复正常生产，重新将CCP处于受控之下，而且受到影响的不合格产品（不一定是不安全）就愈小。纠正措施可以包括在HACCP计划中，而且使工厂的员工能正确地进行操作。应分析产生偏离的原因并予以改正或消除，以防止再次发生。如偏离关键界限不在事先考虑的范围之内（即无已制定好的纠正措施），一旦有可能再次发生偏离CL时，要进行调整加工过程或产品，或者要重新评审HACCP计划。
第二步：隔离、评估和处理在偏离期间生产的产品
a.专家或授权人员，或通过试验（物理、化学、生物）确定这些产品是否存在有食品安全危害；
b.如果没有危害，可以放行；
c.如果有危害，但可通过返工或重新加工或改作他用；
d.销毁：最后的选择，经济损失较大。
返回、返工的产品仍然接受监控或控制，也就是确保返工不能造成或产生新的危害，如热稳定的生物学毒素（金葡菌肠毒素）。
