食品安全管理体系审核是审核的一种类型，其“系统”、“独立”、“形成文件”的特点与“审核”的特点完全相同：
1)所谓“系统”是指审核是一项正式、有序的活动。如外部审核按合同进行，审核需要经过授权，无论是内部审核还是外部审核，都是有组织、有计划并按规定的程序进行的。
2)所谓“独立”是指审核是一项客观、公正的活动，必须以审核准则为依据，尊重事实和证据，不屈服于任何压力，不迁就任何不合理的要求：“客观、公正”还表现在内部审核时审核人员不应审核自己的工作，在第三方审核的情况下不应对受审核方既提供咨询又进行审核等方面。
3)所谓“形成文件”是指审核过程的实施情况及其结果均要适当地形成文件，如审核计划、检查表、抽样计划、审核记录、不符合报告、审核报告等。
