以形态特张最典型的链霉菌为例来阐明放线菌的一般形态和构造。
通过载片培养等方法可清楚地观察到链霉菌细胞呈丝状分枝，菌丝直径很细（< 1μm，与细菌相似）。在营养生长阶段，菌丝内无隔，故一般呈多核的单细胞状态。
基内菌丝（substrate mycelium）：当孢子落在固体基质培养基表面并发芽后，就不断伸长、分枝并以放射状向基质表面和内层扩展，形成大量色浅、较细的具有吸收营养和排泄代谢废物功能的基内菌丝，又称基质菌丝、营养菌丝或一级菌丝。
气生菌丝（aerial mycelium）：基内菌丝不断向空间方向分化出颜色较深、直径较粗的分枝菌丝，这就是气生菌丝或称二级菌丝。
大部分气生菌丝成熟，分化成孢子丝（spore-bearing mycelium），并通过横割分裂方式，产生成串的分生孢子（conidia，spore）
