蓝细菌是一类较古老的原核生物，大约在21亿～17亿年前已形成，它的发展使整个地球大气从无氧状态发展到有氧状态，从而孕育了一切好氧生物的进化和发展。
在人类生活中，蓝细菌有着重大的经济价值，目前已开发成有一定经济价值的“螺旋藻”产品。至今已知有120多种蓝细菌具有固氮功能，特别是与 Anabaena azollae （满江红鱼腥蓝细菌）共生的水生蕨类满江红，是一种良好的绿肥。
