食品安全管理体系最重要、最突出的特点是，它强调组织应确保食品链每个环节所有相关的食品危害均得到识别和充分控制。组织的食品安全管理涉及整个食品链中的各组织，因此，组织与其在食品链中的上游和下游组织之间均需要沟通。尤其对于已确定的危害和采取的控制措施，应与顾客和供方进行沟通，这将有助于明确顾客和供方的要求。
因此，为确保食品安全管理体系有效实施和运行，组织需提供相应的资源包括基础设施和工作环境，并建立合适的组织结构，确定所有员工，特别是食品安全小组在食品安全管理体系中的作用、职责和权限。为了使员工能更好地履行其职责，组织还必须采用培训方式强化其食品安全意识和能力。另外，组织与员工和其他相关方就食品安全问题进行协商和沟通，可以充分调动广大员工和其他相关方参与组织食品安全管理的积极性，使食品安全管理变成全体员工共同的事业。
