食品安全管理体系验证是为了保证它与策划一样发挥作用，并按最新获得的信息及时更新。正常发挥作用的食品安全管理体系可以减少大量产品抽样和检验的需要。验证大致可以分为日常和定期验证两个阶段。
日常验证活动采用的方法、程序和检验区分于甚至多于监控体系时所用的方法、程序和检验。验证报告应包括以下信息：
——体系；
——管理和更新验证的人员；
——与监视活动有关的记录状况；
——证明监视设备已适当的校准，并处于正常工作状态中；
——记录评审和样品分析的结果。
人员培训的记录应评审，评审的结果也应形成文件。
验证活动的计划是食品安全管理体系的一部分（按照GB/T 22000—2006 7.8条策划，根据8.4.2条评估）。计划应包括使用的方法和程序，频率和开展活动人员的职责。作为食品安全管理体系一部分的验证活动应包括，例如：
——评审监视记录；
——评审偏离及其解决或纠正措施，包括处理受影响的产品；
——校准温度计或者其他重要的测量设备；
——直观地检查操作来观察控制措施是否处于受控；
——分析测试或审核监视程序；
——随机收集和分析半成品或终产品样品；
——环境和其他关注内容的抽样；
——评审消费者或顾客的投诉来决定其是否与控制措施的执行有关，或者是否揭示了未经识别的危害存在，是否需要附加的控制措施。
在进行作为验证活动的内部审核（见GB/T 22000—2006 的8.4.1 条）时，应遵守审核的原则。审核员应有能力完成审核，并独立于被审核的工作或过程，尽管他们可能来自相同的工作区域或部门。例如，在一个小的商业组织的管理结构中可能仅有一个或者两个人，这项要求就不能达到。在这种情况下要行使审核员的职责，建议管理者尝试从直接管理运行中退出来，进行客观的审核。
另一种方法是寻求与另外一个企业合作，互相进行内部的审核。此外，外部的相关方（如商会、咨询师和检验机构）也能提供独立审核。
定期验证活动涉及整个体系的评估（见GB/T 22000—2006的8.4.3条)。通常是在管理和验证的小组会议中完成，并评审一个阶段内所有的证据以确定体系是否按策划有效实施，以及是否需要更新或改进。应保持会议记录，其中应包括所有做出与体系有关的决定，至少应每年用此方法来验证整个体系。
