食品安全危害不仅仅是食品中存在的生物的（致病菌、病毒、寄生虫）、化学的（动、植物中天然存在的、人为有意添加的、无意带入的）和物理的（如金属异物、玻璃、碎石等）危害物质，而且还包括食品的存在状态（如烫的饮料）和过敏原（酒精的过敏）等5大类。
本节主要论述生物、化学和物理的危害。
食品安全危害：食品中所含有的对健康有潜在不良影响的生物、化学或物理的因素或食品存在状态。
生物性危害主要指生物（尤其是微生物）本身及其代谢过程、代谢产物（如毒素）对食品原料、加工过程、储运、销售直到使用中的污染，危害人体健康。
化学危害包括三方面：天然存在于植物、动物和微生物中的化学物质；有意加入的化学物质；无意或偶然加（带入）入的化学品。
物理危害是在食品中不正常出现的、可导致伤害的异物，如：金属；玻璃；石块：碎骨等。物理性危害可能造成的后果为划破口腔、损坏牙，外伤，窒息和不利健康的影响。
